BKK Palangka Raya memiliki 2 Pos Bandara dan 4 Wilayah Kerja (Wilker) dalam rangka pelaksanaan tugas pokok dan fungsinya. Adapun Wilker yang ada dibawah koordinasi BKK Kelas II Palangka Raya adalah:
Pos Bandara Tjilik Riwut
 |
| Jalan Adonis Samad, Kelurahan Panarung, Kecamatan Pahandut, Kota Palangka Raya |
Pos Bandara Haji Muhammad Sidik
 |
| Jalan Negara Km.18 Muara Teweh, Kab. Barito Utara |
Wilker Pelabuhan Laut Kapuas
 |
| Jalan Meranti, Kelurahan Selat Tengah, Kec. Selat, Kab. Kapuas |
Wilker Pelabuhan Laut Pulang Pisau
 |
| Jalan Samudera No. 31 Kec. Kahayan Hilir, Kab. Pulang Pisau |
Wilker Pelabuhan Laut Pegatan
 |
| Jalan Al Ikhlas No. 1 Pegatan Hilir, Katingan Kuala |
Wilker Pelabuhan Khusus Kelanis
 |
| Desa Rangga Ilung RT. 15, RW. 05, Rangga Ilung, Kec. Jenamas, Kab. Barito Selatan |
